<P>
&nbsp; <BR>
Sir,<BR>
&nbsp; &nbsp;  I have added the T-couple parameters.&nbsp; No problems in running grompp tpr and trr files are created sucessfully. <BR>
&nbsp; But when i run the final mdrun simulation it returns <BR>
<BR>
&quot;Only triclinic boxes with the first vector parallel to the x-axis and the second vector parallel to the xy-plane are supported <BR>
Box(3x3)<BR>
Box [&nbsp;  0]={&nbsp; nan,&nbsp; nan, nan}<BR>
Box [&nbsp;  1]={&nbsp; nan,&nbsp; nan, nan}<BR>
Box [&nbsp;  2]={&nbsp; nan,&nbsp; nan, nan}<BR>
cannot fix pbc&quot;<BR>
<BR>
What could be wrong Sir.<BR>
<BR>
thanks <BR>
bala<BR>

</P>
<br><br>
<A target="_blank" HREF="http://clients.rediff.com/signature/track_sig.asp"><IMG SRC="http://ads.rediff.com/RealMedia/ads/adstream_nx.cgi/www.rediffmail.com/inbox.htm@Bottom" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>