<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-2">
<META content="MSHTML 6.00.2900.2604" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV>Message: 5<BR>Date: Mon, 28 Mar 2005 22:32:55 +0200<BR>From: David van der 
Spoel &lt;<A 
href="mailto:spoel@xray.bmc.uu.se">spoel@xray.bmc.uu.se</A>&gt;<BR>Subject: Re: 
[gmx-users] Fw: error: interrupt SIGSEGV<BR>To: Discussion list for GROMACS 
users &lt;<A 
href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</A>&gt;<BR>Message-ID: 
&lt;<A 
href="mailto:1112041976.5761.18.camel@vangogh">1112041976.5761.18.camel@vangogh</A>&gt;<BR>Content-Type: 
text/plain; charset=UTF-8<BR>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN 
lang=EN-US></SPAN>&nbsp;</P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN 
lang=EN-US></SPAN>&nbsp;</P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN 
lang=EN-US></SPAN>&nbsp;</P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=EN-US>Thank you for 
suggestions. </SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=EN-US>I&#8217;m using only 
four processors, this error happens usually during simulations that least over 2 
ns.<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;</SPAN></SPAN></P>
<P class=MsoNormal style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><SPAN lang=EN-US><SPAN 
style="mso-spacerun: yes">&nbsp;</SPAN>I checked input files and everything 
seemed fine.<SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp; </SPAN>Should I reinstall 
gromacs? <SPAN style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;</SPAN></SPAN></P><SPAN 
lang=EN-US 
style="FONT-SIZE: 12pt; FONT-FAMILY: 'Times New Roman'; mso-fareast-font-family: 'Times New Roman'; mso-ansi-language: EN-US; mso-fareast-language: PL; mso-bidi-language: AR-SA">Mike&nbsp;<SPAN 
style="mso-spacerun: yes">&nbsp;&nbsp;</SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><BR>On Mon, 2005-03-28 at 21:57 +0200, Kolin wrote:<BR>&gt;&nbsp; <BR>&gt; 
----- Original Message ----- <BR>&gt; From: Michal Kolinski <BR>&gt; To: <A 
href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</A> <BR>&gt; Sent: 
Monday, March 28, 2005 9:03 PM<BR>&gt; Subject: error: interrupt SIGSEGV<BR>&gt; 
<BR>&gt; <BR>&gt; <BR>&gt; Iā?Tm running gromacs on 98 processor&nbsp; AMD 
Opteron 246 2.0GHz cluster.<BR>&gt; <BR>&gt; During my last simulation I get the 
following error:<BR>Can be anything, GROMACS, hardware, MPICH library. Is it 
reproducible?<BR>If not, it is probably not gromacs. Are you really running on 
98<BR>processors?<BR>&gt; <BR><BR>-- <BR>David.</DIV></BODY></HTML>