<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1459" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hi Diego,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>thank you&nbsp; so much for the link, i did find 
one record extremely helpful. Now i have no problem to write out dihedra angles 
for certain residues from my trajectory. </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>nancy</FONT></DIV>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #000000 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV style="FONT: 10pt arial">----- Original Message ----- </DIV>
  <DIV 
  style="BACKGROUND: #e4e4e4; FONT: 10pt arial; font-color: black"><B>From:</B> 
  <A title=diegovallejo@mdq.com.ar href="mailto:diegovallejo@mdq.com.ar">diego 
  vallejo</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>To:</B> <A title=gmx-users@gromacs.org 
  href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Sent:</B> Thursday, May 05, 2005 1:09 
PM</DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Subject:</B> Re: [gmx-users] index 
  definition</DIV>
  <DIV><BR></DIV>I don't know, perhaps this thread is what you need: <BR><BR><A 
  href="http://www.gromacs.org/pipermail/gmx-users/2001-December/000351.html" 
  eudora="autourl">http://www.gromacs.org/pipermail/gmx-users/2001-December/000351.html</A> 
  <BR><BR>(the search form in <A 
  href="http://www.gromacs.org/search/index.php">http://www.gromacs.org/search/index.php</A> 
  is really fine).<BR><BR>Saludos<BR>Diego <BR><BR>&nbsp;At 03:39 p.m. 
  05/05/2005, you wrote:<BR><BR>
  <BLOCKQUOTE class=cite cite="" type="cite"><FONT face=arial size=2>Hi 
    Deigo,<BR></FONT>&nbsp;<BR><FONT face=arial size=2>Thank ... It works 
    perfect now.<BR></FONT>&nbsp;<BR><FONT face=arial size=2>Do you have any 
    clue to define the dihedral angle among any four specified atoms??? If 
    possible, I am thinking to measure the angle between two nearby helix in 
    terms of the customized "dihedrals"....<BR></FONT>&nbsp;</BLOCKQUOTE>
  <P>
  <HR>

  <P></P><BR><BR>No virus found in this outgoing message.<BR>Checked by AVG 
  Anti-Virus.<BR>Version: 7.0.308 / Virus Database: 266.11.0 - Release Date: 
  29/04/2005<BR>
  <P>
  <HR>

  <P></P>_______________________________________________<BR>gmx-users mailing 
  list<BR>gmx-users@gromacs.org<BR>http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<BR>Please 
  don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <BR>www interface or 
  send it to gmx-users-request@gromacs.org.</BLOCKQUOTE></BODY></HTML>