<P>
&nbsp; <BR>
Dear all,<BR>
&nbsp;  Right now I am learning how to operate the Gromacs. I took one 10 repeat unit polymer chain in PDB fromat. Then by using PRODRG I created gromacs coordinates and also the topological file. Then when I tried to run 'grompp' command it is giving me an error as --&quot;Fatal error: Invalid order for directive moleculetype-'filename: topol.top',line---&quot;. I am not able find out the error. <BR>
&nbsp;  I tried to generate gromacs format file using 'pdb2gmx', but it only generates *.top file. <BR>
&nbsp;  Please help me out to sort out this error. I will be grateful to him. Thanking you and waiting for your kine reply.<BR>
<BR>
**************<BR>
Rahul Karyappa<BR>
National Chemical Laboratory<BR>
Pune, India<BR>
**************
</P>


<br><br>
<a href="http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/sigclick.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1507191490@Middle5?PARTNER=3"><IMG SRC="http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/sigimpress.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1963059423@Middle5?OAS_query=null&PARTNER=3" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>