<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=UTF-8" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
<br>
David wrote:
<blockquote cite="mid1123620523.8936.0.camel@localhost.localdomain"
 type="cite">
  <pre wrap="">On Tue, 2005-08-09 at 13:33 -0700, <a
 class="moz-txt-link-abbreviated"
 href="mailto:leafyoung81-group@yahoo.com">leafyoung81-group@yahoo.com</a> wrote:
  </pre>
  <blockquote type="cite">
    <pre wrap="">Hi,

I found that intel C/C++ compiler (v9.0) generates a
mdrun (fftw by icc) which will returns different
topology after each run. Both x86 and x86_64 behaved
the same. Effects from the mdp files shall be excluded
(no_gen=yes).
    </pre>
  </blockquote>
  <pre wrap=""><!---->mdrun does not generate topologies.

please explain.
  </pre>
</blockquote>
Topologies shall mean trajectory and end structure.<br>
<blockquote cite="mid1123620523.8936.0.camel@localhost.localdomain"
 type="cite">
  <blockquote type="cite">
    <pre wrap="">Is this cautious that we shall avoid using icc?
    </pre>
  </blockquote>
  <pre wrap=""><!---->In my tests gcc 3.4.3 gives very good performance. Intel nor Pathscale
improved it by more than 1-2%.
  </pre>
</blockquote>
I will test on this.<br>
<blockquote cite="mid1123620523.8936.0.camel@localhost.localdomain"
 type="cite">
  <pre wrap="">  </pre>
  <blockquote type="cite">
    <pre wrap="">Yang Ye

_______________________________________________
gmx-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext"
 href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the 
www interface or send it to <a class="moz-txt-link-abbreviated"
 href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.
    </pre>
  </blockquote>
</blockquote>
</body>
</html>