<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.6944.0">
<TITLE>RE: [gmx-users] A SGI Altix 3700 system with 512 Itanium 2 processorsand 1Terabyte of memory</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>Hi Erick,<BR>
<BR>
I have alredy asked the admistrators to do the installation. If they do I will let you know how it goes.<BR>
<BR>
Thanking you,<BR>
<BR>
abu<BR>
<BR>
<BR>
-----Original Message-----<BR>
From: gmx-users-bounces@gromacs.org on behalf of Erik Lindahl<BR>
Sent: Fri 9/2/2005 1:00 PM<BR>
To: Discussion list for GROMACS users<BR>
Subject: Re: [gmx-users] A SGI Altix 3700 system with 512 Itanium 2 processorsand 1Terabyte of memory<BR>
<BR>
Hi,<BR>
<BR>
Altix is yet another platform we haven't been able to test ourselves,&nbsp;<BR>
so please test the new release candidate for 3.3 and report any&nbsp;<BR>
compile or runtime errors (preferrably through <A HREF="http://">http://</A><BR>
bugzilla.gromacs.org).<BR>
<BR>
There are both single and double precision Itanium2 loops that&nbsp;<BR>
hopefully should work.<BR>
<BR>
Cheers,<BR>
<BR>
Erik<BR>
<BR>
<BR>
On Sep 1, 2005, at 3:28 PM, Mark Abraham wrote:<BR>
<BR>
&gt; Naser, Md Abu wrote:<BR>
&gt;<BR>
&gt;&gt; Hi All,<BR>
&gt;&gt; A double precision version of gromacs (3.2.1) was installed on A&nbsp;<BR>
&gt;&gt; SGI Altix 3700 . Everything else is fine but when I run mdrun_d it&nbsp;<BR>
&gt;&gt; gives me following error. Can any one advise me where might be the&nbsp;<BR>
&gt;&gt; problems?<BR>
&gt;&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt; Hi,<BR>
&gt;<BR>
&gt; I posted about two months back about single precision gromacs 3.2.1&nbsp;<BR>
&gt; on an Altix 3700B running pretty dismally - slower than a new Dell&nbsp;<BR>
&gt; Dimension Pentium 4. That gromacs version doesn't have optimized&nbsp;<BR>
&gt; inner loops for Itanium 2 chips, but current CVS versions do &amp; the&nbsp;<BR>
&gt; speedup on single precision was appreciable. Both single and double&nbsp;<BR>
&gt; versions of 3.3beta CVS versions work on the machine I use. I'd&nbsp;<BR>
&gt; suggest getting a version upgrade and hoping the problem goes away :-)<BR>
&gt;<BR>
&gt; Mark<BR>
&gt; _______________________________________________<BR>
&gt; gmx-users mailing list<BR>
&gt; gmx-users@gromacs.org<BR>
&gt; <A HREF="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</A><BR>
&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the www&nbsp;<BR>
&gt; interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
<BR>
_______________________________________________<BR>
gmx-users mailing list<BR>
gmx-users@gromacs.org<BR>
<A HREF="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</A><BR>
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<BR>
www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>