<html>
<body>
g_dist<br><br>
do a *.ndx file with two groups, with one atom in each group. g_dist will
measure distance between these vs.time.<br><br>
<br>
saludos<br>
Diego Vallejo<br><br>
At 08:32 a.m. 13/09/2005, you wrote:<br><br>
<blockquote type=cite class=cite cite="">Dear all,<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; I want to measure end-to-end distance of the chain.
How can I measure it? I measured the radius of gyration by using g_gyrate
but what about end-to-end distance?<br><br>
looking forward to your kind reply.<br><br>
Rahul Karyappa<br>
NCL, Pune<br>
*****************************************************************<br>
This email is virus free by TrendMicro Inter Scan Security Suite.<br>
*****************************************************************<br>
_______________________________________________<br>
gmx-users mailing list<br>
gmx-users@gromacs.org<br>
<a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" eudora="autourl">
http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>
www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br><br>
No virus found in this incoming message.<br>
Checked by AVG Anti-Virus.<br>
Version: 7.0.344 / Virus Database: 267.10.23/99 - Release Date:
12/09/2005</blockquote></body>
</html>