<br><br><div><span class="gmail_quote">On 9/26/05, <b class="gmail_sendername">Dallas B. Warren</b> &lt;<a href="mailto:Dallas.Warren@vcp.monash.edu.au">Dallas.Warren@vcp.monash.edu.au</a>&gt; wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
&gt; this has happened to me too, everything seemed to be ok, but<br>&gt; the .edr file was empty. After many runs which I interrupted<br>&gt; because of the leck of the energies, I decided to let it go<br>&gt; thruogh till the end of the simulation: the .edr file was
<br>&gt; written, don't ask me why, because I run every simulation<br>&gt; with the same .mdp file and this perfectly worked for any<br>&gt; other system but that one! So try and let the simulation<br>&gt; reach the end, you may be as lucky as I was.
<br><br>In
that case it is due to the computer itself that it is being run
on.&nbsp;&nbsp;To avoid heavy writing to the hard disks, it will wait
until the amount of information reaches a certain size, until then
holding it in memory, then dumps it to the disk.&nbsp;&nbsp;Seems like
the edr file is smaller than what ever that size limit is for your
operating system build.</blockquote><div><br>
that is strange, I also thought the same thing at first, then I've
tried and ran my simulation on a different machine but the result was
the same!<br>
thanks anyway, <br>
Magiofer<br>
</div><br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Catch ya,<br><br>Dr. Dallas Warren<br>Lecturer<br>Department of Pharmaceutical Biology and Pharmacology
<br>Victorian College of Pharmacy, Monash University<br>381 Royal Parade, Parkville VIC 3010<br><a href="mailto:dallas.warren@vcp.monash.edu.au">dallas.warren@vcp.monash.edu.au</a><br>+61 3 9903 9073<br>---------------------------------
<br>When the only tool you own is a hammer, every problem begins to resemble a nail.<br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list<br><a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org
</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">
gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br></blockquote></div><br>