<html><div style='background-color:'><P>&nbsp;tip4p and tip3p water molecules are defined using costraints.</P>
<P>To minimize an RNA molecule I used the steep integrator<BR><BR></P>
<BLOCKQUOTE style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #a0c6e5 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px"><FONT style="FONT-SIZE: 11px; FONT-FAMILY: tahoma,sans-serif">
<HR color=#a0c6e5 SIZE=1>
From: <I>"???" &lt;qiwenpeng@sinap.ac.cn&gt;</I><BR>Reply-To: <I>Discussion list for GROMACS users &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;</I><BR>To: <I>&lt;gmx-users@gromacs.org&gt;, &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;</I><BR>Subject: <I>[gmx-users] ERROR: can not do Conjugate Gradients with constraints(8709)</I><BR>Date: <I>Wed, 9 Nov 2005 07:55:45 +0800</I><BR><BR>
<META content="Microsoft SafeHTML" name=Generator>
<P><FONT size=2>Dear All:<BR><BR>I use ffamber94/99 force field in double precision gromacs3.2.1/3.3 to simulate the dickerson DNA.<BR><BR>I use cg, there is the ERROR: can not do Conjugate Gradients with constraints (8709)<BR><BR>so I tried before the genbox_d (only DNA in a box),it is ok.<BR><BR>Why?<BR><BR>Can anybody help me!<BR><BR>thanks a lot.<BR><BR><BR>Ryan</FONT> </P><BR>
<P>&gt;_______________________________________________<BR>&gt;gmx-users mailing list<BR>&gt;gmx-users@gromacs.org<BR>&gt;http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<BR>&gt;Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<BR>&gt;www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<BR>
<P></FONT></P></BLOCKQUOTE></div><br clear=all><hr>Ricerche online pił semplici e veloci con  <a href="http://g.msn.com/8HMAITIT/2740??PS=47575" target="_top">Parla con i tuoi amici che hanno MSN Hotmail in tempo reale! E' gratis.</a> </html>