<div>Hi Guys,</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>I want to include polarizable water in my simulations. After a suggestion by David van der Spoel I tried&nbsp;manually editing the .top file for a protein in a box of non polarizable water (i.e. adding the water molecules as residues and including &quot;
shell.itp&quot; under [SOLVENT]) but&nbsp;I failed.&nbsp;Where do you think I have gone wrong.&nbsp;&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Thanks</div>
<div>Mike</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div>