<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">

<html>

<head>

  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">

</head>

<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">

Try use table (see manual 6.4.2). Note that there is new option

available in 3.3 that you can assign different table for the

interactions between different groups of atoms. Check 3.3's document

(share/html/online.html), section "mdp option".<br>

<br>

Yang Ye<br>

<br>

<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Junfang.Zhang@csiro.au">Junfang.Zhang@csiro.au</a> wrote:

<blockquote

 cite="mid73141978E50F334AB7042807A520525E5D7434@exvicn1-mel.nexus.csiro.au"

 type="cite">

  <pre wrap="">Dear Gromacs users,

If I use the MCY potential which takes the form as follows

(a exp (-br) - c exp (-dr) + qq/r),

which source files in GROMACS do I need to modify?

Thanks,

Junfang

_______________________________________________

gmx-users mailing list

<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>

<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>

Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the 

www interface or send it to <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.

  </pre>

</blockquote>

<br>

<div class="moz-signature">-- <br>

<i>Regards,</i><br>

Yang Ye<br>

<small><i>Computational Biology Lab<br>

School of Biological Sciences<br>

Nanyang Technological University<br>

Singapore<br>

Tel: 6316-2884<br>

</i></small>

</div>

</body>

</html>