Well, I have Gromacs-3.3&nbsp; with single precision. <br>
<br>
lam-7.0.6 is alrady installed and fftw-3.0.1 with double precision is also installed.<br>
befire excuting following steps I have gone through following steps:<br>
<br>
<font color="#ffffff" style="color: rgb(0, 0, 0);"><tt>export CPPFLAGS=-I/usr/local/includ<br>
</tt></font><font color="#ffffff" style="color: rgb(0, 0, 0);"><tt>
export LDFLAGS=-L/usr/local/lib</tt></font><br>
<br>
then for Gromacs-3.3 with double precission I took following steps:<br>
<br>
1.&nbsp; make distclean<br>
2. ./configure --disable-float&nbsp; --enable-shared<br>
3. make <br>
<br>
make has generated following error:<br>
<br>
collect2: ld returned 1 exit status<br>
make[3]: *** [grompp] Error 1<br>
make[3]: Leaving directory `/usr/data/dhananjay/Dhananjay_installation/Gromacs/gromacs-3.3/src/kernel'<br>
make[2]: *** [all-recursive] Error 1<br>
make[2]: Leaving directory `/usr/data/dhananjay/Dhananjay_installation/Gromacs/gromacs-3.3/src'<br>
make[1]: *** [all] Error 2<br>
make[1]: Leaving directory `/usr/data/dhananjay/Dhananjay_installation/Gromacs/gromacs-3.3/src'<br>
make: *** [all-recursive] Error 1<br>
<br>
<br>
What is wrong here ?<br>
<br><br><div><span class="gmail_quote">On 1/19/06, <b class="gmail_sendername">David van der Spoel</b> &lt;<a href="mailto:spoel@xray.bmc.uu.se">spoel@xray.bmc.uu.se</a>&gt; wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Dhananjay wrote:<br>&gt; Hello all,<br>&gt;<br>&gt; I got error in installation of gromacs in double precision. The error is<br>&gt; as follows:<br>&gt;<br>&gt; collect2: ld returned 1 exit status<br>&gt; make[3]: *** [grompp] Error 1
<br>&gt; make[3]: Leaving directory<br>&gt; `/usr/data/dhananjay/Dhananjay_installation/Gromacs/gromacs-3.3/src/kernel'<br>&gt; make[2]: *** [all-recursive] Error 1<br>&gt; make[2]: Leaving directory<br>&gt; `/usr/data/dhananjay/Dhananjay_installation/Gromacs/gromacs-
3.3/src'<br>&gt; make[1]: *** [all] Error 2<br>&gt; make[1]: Leaving directory<br>&gt; `/usr/data/dhananjay/Dhananjay_installation/Gromacs/gromacs-3.3/src'<br>&gt; make: *** [all-recursive] Error 1<br>&gt;<br>&gt; I have followed all the steps given on the web and still grtting this error.
<br>&gt;<br>&gt; Please tell me what is wrong here ?<br>you have not send the interesting bit of information, right before this,<br>i.e. the real error.<br>what platform is this?<br><br>&gt;<br>&gt; -- Dhananjay<br>&gt;<br>
&gt;<br>&gt; ------------------------------------------------------------------------<br>&gt;<br>&gt; _______________________________________________<br>&gt; gmx-users mailing list<br>&gt; <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">
gmx-users@gromacs.org</a><br>&gt; <a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
&gt; www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br><br><br>--<br>David.<br>________________________________________________________________________<br>David van der Spoel, PhD, Assoc. Prof., Molecular Biophysics group,
<br>Dept. of Cell and Molecular Biology, Uppsala University.<br>Husargatan 3, Box 596,&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;75124 Uppsala, Sweden<br>phone:&nbsp;&nbsp;46 18 471 4205&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;fax: 46 18 511 755<br><a href="mailto:spoel@xray.bmc.uu.se">spoel@xray.bmc.uu.se
</a>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:spoel@gromacs.org">spoel@gromacs.org</a>&nbsp;&nbsp; <a href="http://folding.bmc.uu.se">http://folding.bmc.uu.se</a><br>++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++<br>_______________________________________________
<br>gmx-users mailing list<br><a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the
<br>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br></blockquote></div><br>