All,<br>
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For the record, I just submitted a bugzilla on angle restraints: It
seems they don't work (get turned off, silently) when free_energy=yes
in the input (Gromacs 3.3). Output angle energies and angle energies in
the log file are zero.<br>
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This would affect anyone who used angle restraints in conjunction with
free energy calculations. I hadn't noticed before because I use the
angle restraints also *without* free energy calculations, where they
work fine, so I (naively) assumed they would work fine with free energy
calculations as well, especially since there are no warnings, etc.<br>
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David Mobley<br>
UCSF<br>