Hello gmx-users,<br>
I would like to clarify one point in my work. I have simulated a protein in explicit solvent with position restraint at 300K. Then in the second simulation I removed posititon restraint from the system and used previous .trr file as the restart file and in .mdp I made gen_vel = no, the simulation ended with lincs error. Changing uncostrained_start parameter to yes/no does not make effect.<br>
Then I only changed gen_vel = yes, the simulation has continued to the end normally.<br>
Could anyone give any idea for this?<br>
<br>
Thanks<br>
Mustafa<br>
<br>

<br>

<p>
<br>
</p><br><br>
<div>
<a href="http://ads.superonline.com/click.ng/c1=35&c2=3502&c4=003&c5=001" target="_blank">
<img width="468" height="60" border="0" src="http://ads.superonline.com/image.ng/c1=35&c2=3502&c4=003&c5=001">
</a>
</div>
<br>