Dear users,<br>
<br>
I have a ligand obtained in the PRODRG2 server and I
want to do a MD in a methanol box, however the topology of methanol
distributed with gromacs is compatible with ffG43a1 force field and the
ligand was build in gromos 87 format and I got next errors if I use
ffgmx :
<br>
<br>
Fatal error: Invalid order for directive atomtypes, file &quot;&quot;methanol.itp&quot;&quot;, line 3<br>
<br>
while in a water box this work fine.&nbsp; <br>
I need to build the topologies for the corresponding force field or there is another kind to fix it?
<br>
<br>
Thanks in advance,<br>
<span class="sg"><br>Gerardo Perez Hernandez</span>