Dear All,<br><br>I am planning to perform MD simulations with some D-amino acids. I normally use OPLS-AA with GROMACS 3.2.1, but I think it won't work if D-amino acids&nbsp; are used. The FF torsion potential would not be suitable for those aminoacids. <br><br>Should I use the OPLS with D-amino acids? or would be better to use another force field?, or in the case no FF is suitable, which kind of modifications should I do on it??<br><br>Thank you in advance for your valuable help,<br><br>-Arnold<p>
                <hr size=1> Yahoo! Mail<br> 
<a href="http://pa.yahoo.com/*http://us.rd.yahoo.com/evt=38867/*http://photomail.mail.yahoo.com">Use Photomail</a> to share photos without annoying attachments.