Dear GMX ers<br> I would like to compute the position of a small molecule inside a lipid bilayer as a function of its position along the Z axis. Which GMX program is best suited for this?<br> <br> I tried using g_traj, but I got some weird results when i computed the COM position of a DPPC molecule. The COM position of DPPC was crossing the center of the lipid bilayer which is weird.<br> Thanks<br> Rama<br> <p>
                <hr size=1>Brings words and photos together (easily) with<br> 
<a href="http://us.rd.yahoo.com/mail_us/taglines/PMall/*http://photomail.mail.yahoo.com">PhotoMail </a> - it's free and works with Yahoo! Mail.