Could you please more explain?<BR><BR><B><I>Alan Dodd &lt;anoddlad@yahoo.com&gt;</I></B> wrote:  <BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">Upper/lower case matters for atom names.<BR><BR>--- jahanshah ashkani <ASHKANI_2003@YAHOO.COM>wrote:<BR><BR>&gt; hi,<BR>&gt; I have a protein with 1277 residue. I added 131<BR>&gt; NA+ to my .gro and .top files by genion_d and manual<BR>&gt; adaptation. But I have a problem in grompp_d run:<BR>&gt; "WARNING: atom names in .top and .gro don't match<BR>&gt; (NA-Na),..."<BR>&gt; I would be glad if you help me in this case.<BR>&gt; Thank you very much.<BR>&gt; <BR>&gt; Sincerely yours,<BR>&gt; Jahan<BR>&gt; <BR>&gt; <BR>&gt; ---------------------------------<BR>&gt; Yahoo! Messenger with Voice. PC-to-Phone calls for<BR>&gt; ridiculously low rates.&gt;<BR>_______________________________________________<BR>&gt; gmx-users mailing list gmx-users@gromacs.org<BR>&gt;
 http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<BR>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the<BR>&gt; list. Use the <BR>&gt; www interface or send it to<BR>&gt; gmx-users-request@gromacs.org.<BR>&gt; Can't post? Read<BR>http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php<BR><BR><BR>__________________________________________________<BR>Do You Yahoo!?<BR>Tired of spam? Yahoo! Mail has the best spam protection around <BR>http://mail.yahoo.com <BR>_______________________________________________<BR>gmx-users mailing list gmx-users@gromacs.org<BR>http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<BR>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<BR>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<BR>Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php<BR></BLOCKQUOTE><BR><p>
                <hr size=1>Blab-away for as little as 1¢/min. Make <a href="http://us.rd.yahoo.com/mail_us/taglines/postman2/*http://us.rd.yahoo.com/evt=39663/*http://voice.yahoo.com"> PC-to-Phone Calls</a> using Yahoo! Messenger with Voice.