<table width=100%><tr><td>
<P>Hi!</P>
<P>I am not quite&nbsp;sure I have understood the&nbsp;way the ASCII version of the covariance matrix (-ASCII option of g_covar) has been constructed...</P>
<P>In my test system I have&nbsp;3 atoms - this will give a 9X9 cov. matrix.</P>
<P>In the help of g_covar the order the covar.dat file&nbsp;is:</P>
<P>first row: x1x1&nbsp;x1y1 x1z1&nbsp;</P>
<P>second row x1x2...</P>
<P>I would guess:</P>
<P>first row:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; x1x1 x1y1 x1z1</P>
<P>second row &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; x1x2 x1y2 x1z2</P>
<P>third row&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; x1x3 x1y3 x1z3</P>
<P>fourth row&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; y1x1 y1y1 y1z1</P>
<P>So far so good, but in the fifth row I would expect</P>
<P>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; y2x1 y2y1 y2z1</P>
<P>but the values do not match...</P>
<P>As a matter of fact, I want to calculate the determinant of the covariance matrix.</P>
<P>Best regards.</P>
<P>Maki Yoshizawa</P>
<P>&nbsp;</P>
</td></tr></table>
<p><p><p><br><hr size=1>
<a target="_blank"  href="http://pr.mail.yahoo.co.jp/10thann/">Celebrate Yahoo! JAPAN 10th Anniversary</a><br>