<br>
Hi Jahan,<br>
<br>
setenv is cshell (csh/tcsh). Are you by chance running in bash shell? Then you should use export DSSP=/path/dssp<br>
<br>
Tsjerk<br><br><div><span class="gmail_quote">On 4/27/06, <b class="gmail_sendername">jahanshah ashkani</b> &lt;<a href="mailto:ashkani_2003@yahoo.com">ashkani_2003@yahoo.com</a>&gt; wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div style="direction: ltr;"><div style="margin: 0in 0in 0pt;"><font face="Times New Roman" size="3">Hi,</font></div>  <div style="margin: 0in 0in 0pt;"><font face="Times New Roman" size="3">I
have a problem with do_dssp command. When I ran it, I found this fatal
error " DSSP executable &lt;/usr/local/bin/dssp&gt; does not exist.
Then I used from setenv DSSP command, but I found this error "setenv is
not recognized as an internal or external command,.."</font></div>  <div style="margin: 0in 0in 0pt;"><font face="Times New Roman" size="3">I would be glad if you help me in this case.</font></div>  <div style="margin: 0in 0in 0pt;">
<font face="Times New Roman" size="3">Thank you very much.</font></div>  <div style="margin: 0in 0in 0pt;"><font face="Times New Roman" size="3">&nbsp;</font></div>  <div style="margin: 0in 0in 0pt;"><font face="Times New Roman" size="3">
Sincerely yours,</font></div>  <div style="margin: 0in 0in 0pt;"><font face="Times New Roman" size="3">Jahan</font></div></div><div style="direction: ltr;"><span class="ad"><p>
                </p><hr size="1">Yahoo! Messenger with Voice. <a href="http://us.rd.yahoo.com/mail_us/taglines/postman1/*http://us.rd.yahoo.com/evt=39663/*http://voice.yahoo.com" target="_blank" onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)">
Make PC-to-Phone Calls</a> to the US (and 30+ countries) for 2¢/min or less.
<p></p></span></div><br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>
<br><a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the
<br>www interface or send it to <a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can't post? Read <a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">
http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><br>Tsjerk A. Wassenaar, M.Sc.<br>Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute (GBB)<br>Dept. of Biophysical Chemistry
<br>University of Groningen<br>Nijenborgh 4<br>9747AG Groningen, The Netherlands<br>+31 50 363 4336<br>