<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=koi8-r">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1106" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Dear Gromax list members,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I am trying to convert spc216.gro to tip3p216.gro. 
And to learn how to do this I try water tutorial. But input spc216.gro included 
in the tutorial has box dimentions 1.86206 in all three axes, but if I&nbsp;do 
pdb2gmx -f&nbsp;spc216.pdb -o spc216.gro -p spc216.top then I obtain spc216.gro 
with the next box dimentions 1.96800 1.99700 1.96900 at the bottom of the .gro 
file. So is this difference important for subsequent equilibration and if yes 
what can I do to obtain box sizes given in tutorial spc216.gro.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>D. Egorov,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>USMA, Russia, 
Yekaterinburg.</FONT></DIV></BODY></HTML>