<div>Thanks,</div>  <div>In fact I have a sequence with 1277 residue. It is stable even in 50ps. But when I continue to simulation my pc is restarted in 40000 steps, automaticly. I should say that this step needs about 100 h time.<BR><BR><B><I>"Dallas B. Warren" &lt;Dallas.Warren@vcp.monash.edu.au&gt;</I></B> wrote:</div>  <BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">&gt;How many ps needs a simulation?<BR><BR>How long is a piece of string?<BR><BR>Seriously though, depends on what you are trying to observe and<BR>determine.<BR><BR>Also check the literature to see what is currently being done with<BR>similar systems and properties.<BR><BR>"Typically" it will be at least an order of magnitude longer than the<BR>process you wish to observe. But what is possible and what you want can<BR>be very too different things.<BR><BR>Catch ya,<BR><BR>Dr. Dallas Warren<BR>Lecturer<BR>Department of Pharmaceutical Biology and
 Pharmacology<BR>Victorian College of Pharmacy, Monash University<BR>381 Royal Parade, Parkville VIC 3010<BR>dallas.warren@vcp.monash.edu.au<BR>+61 3 9903 9524<BR>---------------------------------<BR>When the only tool you own is a hammer, every problem begins to resemble<BR>a nail. <BR>_______________________________________________<BR>gmx-users mailing list gmx-users@gromacs.org<BR>http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<BR>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <BR>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<BR>Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php<BR></BLOCKQUOTE><BR><p>
                <hr size=1><a href="http://us.rd.yahoo.com/mail_us/taglines/postman3/*http://us.rd.yahoo.com/evt=39666/*http://messenger.yahoo.com">Yahoo! Messenger with Voice.</a> PC-to-Phone calls for ridiculously low rates.