<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<META content="MSHTML 6.00.2900.2873" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=336401412-20052006>Dear 
all,</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=336401412-20052006>I tried to used the 
program trjorder (in the version 3.3.1) like this:</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=336401412-20052006></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=336401412-20052006><STRONG>trjorder -f xtc_4.xtc -s tpr_4.tpr -n index.ndx 
-o ordered.xtc -b 0 -e 10 -r 0.3</STRONG></SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=336401412-20052006></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=336401412-20052006>But the program 
always output nshell.xvg file,&nbsp;without ordered.xtc file. And I also tried 
this program in 3.2.1 using the same set of input files and got the right .xtc 
output file.</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=336401412-20052006></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=336401412-20052006>Anyone used this 
program and give some solution for this? Thank you very 
much.</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=336401412-20052006></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=336401412-20052006>Zhongqiao 
HU</SPAN></FONT></DIV></BODY></HTML>