can you please send this paper to me? email address : <a href="mailto:karamyog.singh@gmail.com">karamyog.singh@gmail.com</a><br>
<br>
regards, <br>
karamyog.<br><br><div><span class="gmail_quote">On 5/22/06, <b class="gmail_sendername">David van der Spoel</b> &lt;<a href="mailto:spoel@xray.bmc.uu.se">spoel@xray.bmc.uu.se</a>&gt; wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
A B wrote:<br>&gt; I am curious about the reason for the heating that allegedly occurs with<br>&gt; cutoffs in NVE simulations (&quot;The use of (electrostatic) cutoffs is well<br>&gt; known to cause heating in NVE simulations.&quot;). This should not, and does
<br>&gt; not, happen if an appropriate smoothing function is applied. Does this<br>&gt; heating mean that cutoffs are implemented in a sub-optimal fashion in<br>&gt; GROMACS, or is it just a bug? Adding a heat bath would just hide the
<br>&gt; symptom, since there would still be an energy flow from the heat source,<br>&gt; so simulations in other ensembles would also be affected?<br><br>Please refer to my recent paper, J. Chem. Theor. Comp. 2 (2006) 1-11.
<br><br>&gt;<br>&gt; _________________________________________________________________<br>&gt; Lev livet lite sundare. MSN Hälsa. <a href="http://www.msn.se/halsa/">http://www.msn.se/halsa/</a><br>&gt;<br>&gt; _______________________________________________
<br>&gt; gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>&gt; <a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
<br>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the www<br>&gt; interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>&gt; Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">
http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br><br><br>--<br>David.<br>________________________________________________________________________<br>David van der Spoel, PhD, Assoc. Prof., Molecular Biophysics group,
<br>Dept. of Cell and Molecular Biology, Uppsala University.<br>Husargatan 3, Box 596,&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;75124 Uppsala, Sweden<br>phone:&nbsp;&nbsp;46 18 471 4205&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;fax: 46 18 511 755<br><a href="mailto:spoel@xray.bmc.uu.se">spoel@xray.bmc.uu.se
</a>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:spoel@gromacs.org">spoel@gromacs.org</a>&nbsp;&nbsp; <a href="http://folding.bmc.uu.se">http://folding.bmc.uu.se</a><br>++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++<br>_______________________________________________
<br>gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the
<br>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php
</a><br></blockquote></div><br>