<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7233.69">
<TITLE>Free volume: Pass and Gromacs</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>Hi all<BR>
I wonder if anybody has been using Pass to measure free volume: I got these errors:<BR>
<BR>
-Error:&nbsp; Found an odd element (B) on atom #13454.&nbsp; Hydrogen radius assigned.<BR>
Suggestion: Do I have to remove all the dummies?<BR>
<BR>
-Segmentation fault<BR>
Suggestion: I use trjconv to get a pdb; is it possible that I am doing some mistake in the conversion?<BR>
<BR>
Thanx<BR>
<BR>
Alessandro Mattozzi<BR>
M.Phil., Ph.D. student<BR>
Dept. of Fibre and Polymer Technology<BR>
Royal Institute of Technology<BR>
Stockholm, Sweden<BR>
<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>