<HTML>
<HEAD>
<TITLE>No topology</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<FONT FACE="Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE='font-size:12.0px'>I just want to generate the topology of one protein with water. Previously I had obtained the archive .gro from a .pdb, I used editconf to make a box after I used genbox to add waters to protein. The archive .gro is generated but I have tried many times and with other proteins and I can't generate the archive .top<BR>
<BR>
I am using the correct command: genbox -cp protein.gro &nbsp;-cs spc216.gro -o proteinw.gro -p proteinw.top<BR>
<BR>
The error that I recive is:<BR>
<BR>
<BR>
<B>Processing topology<BR>
-------------------------------------------------------<BR>
Program genbox, VERSION 3.3.1<BR>
Source code file: futil.c, line: 340<BR>
<BR>
File input/output error:<BR>
proteinw.top<BR>
-------------------------------------------------------<BR>
</B><BR>
<BR>
I will thank if someone can help me.<BR>
<BR>
<BR>
-- <BR>
Edgar Mixcoha Hern&aacute;ndez, Chemist, BSc<BR>
Laboratorio de Bioqu&iacute;mica, Edificio de Posgrado<BR>
Escuela Nacional de Medicina y Homeopat&iacute;a, IPN<BR>
Lab +52 55 5729 6000 ext 55562<BR>
Mobile +52 55 2955 2219<BR>
______________________________<BR>
</SPAN></FONT>
</BODY>
</HTML>