<div>Dear all,</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>I am doing the simulation of a protein with a small molecular in its active site.</div>
<div>But unfortunately, pdb2gmx cannot generate the gro and top file for the small molecualr?</div>
<div>I am using the oplsaa force field, who can tell me how to generate the gro and top files?</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Thanks a lot</div>
<div>Jian</div>