<br clear="all">Dear all 
<div>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;There is a phosphate tyr in my protein, so when pdb2gmx, the fatal error is &quot;atom p is not found&quot;</div>
<div>&nbsp;&nbsp; </div>
<div>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; How to deal&nbsp; with this problem? how to add the topology file of phosphate ion to residue database?</div>
<div>&nbsp;&nbsp; </div>
<div>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Thank you very much</div><br>-- <br>Na Zhang<br>Chemistry Department<br>Zhejiang University PRC<br><a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="mailto:xbcdnana@gmail.com" target="_blank">xbcdnana@gmail.com
</a>