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<TITLE>How do Charge Groups work?</TITLE>

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<P><FONT SIZE=2>Dear Gromacs Users,<BR>

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I had a system where I have no charges in it, but I do have Lennard-Jones non-bonded interactions. I've noticed that I get different values for the Lennard-jones interaction energy differs depending how I split the system up into charge groups (as the charge group concept is kinda abitrary in a system with no charges), this can not be right surely?<BR>

<BR>

As I understood it the charge groups were used to help compile the neighbour lists, but what I want is all the atoms within my cut-off radius to be in my pair-list (for that atom). Is there an option to ignore the charge groups? I find I get bigger Lennard-Jones interactions if I put my whole system into a charge group that if I split it up, but I need to split it up for my larger systems. Is there a way to increase the maximum number of charge groups? And is this a good idea?<BR>

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I'm quite confused I'm afraid.<BR>

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Thank you all for your ongoing help!<BR>

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Regards<BR>

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Ella Gale<BR>

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</FONT>

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