Dear users, I have a system with just one atom. I am using periodic
boundary conditions. No matter what conditions I use, the atom doesnt
seem to move. Are a minimum of 2 atoms required to do a simulation in
Gromacs? If I have only one atom and I am using periodic boundary
conditions then whether I have interaction potential or not, the atom
should move with some velocity. However this does not happen. Can
anyone tell me what is the reason for that?<br>
<br>
Thanks.<br>
Karamyog Singh.<br>
<br>