<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2900.2912" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hi,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Anybody knows if there is some way to tell 
pdb2gmx&nbsp;to recognize&nbsp;automatically S-S bonds and not through the 
modification of specbond.dat file&nbsp;and -ss option???</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Regards,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>César.-</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial 
size=2>-----------------------------------------------------------<BR>Cesar 
Araujo, Lic. of Chemistry<BR>Department of Molecular Endocrynology<BR>Oulu 
University Hospital<BR>FIN-90029 OYS, FINLAND</FONT></DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>phone: +358 8 3155632<BR>e-mail: <A 
href="mailto:cesar.araujo@oulu.fi">cesar.araujo@oulu.fi</A><BR></FONT></DIV></BODY></HTML>