<blockquote class="replbq" style="border-left: 2px solid rgb(16, 16, 255); margin-left: 5px; padding-left: 5px;">Hi, I have recently run a MD in gromacs 3.3.1. I would like to calculate the interaction energy between protein and the ligand which i have used. If I use the options LJ-SR or LJ-LR the program is considering it as LJ-14 and giving the same result. <br> <br> Many thanks in advance.<br> <br> Rajaram<br>  <div>    </div><hr size="1"></blockquote><p>&#32;
                <hr size=1>Groups are talking. We&acute;re listening. Check out the <a href="http://pa.yahoo.com/*http://us.rd.yahoo.com/evt=41144/*http://groups.yahoo.com/local/newemail.html">handy changes to Yahoo! Groups.</a>