Dear all:<br>

<pre><font size="4">I want to use <span style="font-weight: bold;">Fene Potential</span> and <span style="font-weight: bold;"><span style="font-weight: bold;">Q</span>uartic Angle Potential</span> which both are available in the new gromacs version 
</font><font size="4">3.3 . What I want to know is how can I  set up the parameters for these potential in my *.itp file. Ok my try is here. Are the possition of the parameters  ok? and Are the number of functs ok for boht Fene and quartic?. I took the information from the manual reference 
</font><font size="4">3.3 ( page 97 ). Thanks in advance.<br><br></font><font size="4"><span style="font-weight: bold;"><span style="font-weight: bold;">;</span>FORCE FIELD  FOR POLYELECTROLYTES WITH COUNTERIONS </span><br>
[ defaults ]<br> 1       2<br><br>[ atomtypes ]<br>; name  bond_type    mass    charge   ptype     sigma      epsilon<br><br>[ nonbond_params ]<br>; i            j        funda       sigma          epsilon <br>     <span style="font-weight: bold;">
<br>;;COUNTERIONS<br></span><br>[ moleculetype ]<br>; molname       nrexcl<br><br>[ atoms ]<br>;id type resnr residu  atom  cgnr   charge<br> <br><span style="font-weight: bold;">;;POLYELECTROLYTE </span><br><br>[ moleculetype ]
<br><br>; molname       nrexcl<br><br>[ atoms ]<br>;id    type  resnr   residu    atom     cgnr  charge<br></font> <br><font size="4">[ bonds ] ; <span style="font-weight: bold;">FENE potential</span><br>;  i   j<span style="font-weight: bold; color: rgb(255, 0, 0);">
funct   </span><span style="color: rgb(255, 0, 0);">bo      kb</span><br>   1   2  <span style="font-weight: bold; color: rgb(255, 0, 0);">7</span>      2        7<br><br>[ angles ] ; <span style="font-weight: bold;">QUARTIC ANGLE potential
</span><br>; i  j  k</font><font size="4"><span style="font-weight: bold; color: rgb(255, 0, 0);">funct </span><span style="color: rgb(255, 0, 0);">th0  C0  C1  C2  C3  C4</span><br>  1  2  3  <span style="font-weight: bold; color: rgb(255, 0, 0);">
6</span>   180   0   0   5   0   200</font>
</pre>

<br>
-- <br>
Cheers,&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>
Paul <br>
National Tsing Hua University (ÇåÈA´óŒW)<br>
<br>
ÖxÖxÄãµÄŽÍæ<br>
I appreciate your help. Thanks!<br>
Os agradezco la ayuda. Gracias!