<p class="MsoNormal" style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><span lang="EN-US" style="COLOR: black; FONT-FAMILY: Arial; mso-ansi-language: EN-US">HI! I have a problem.</span></p>
<p class="MsoNormal" style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><span lang="EN-US" style="COLOR: black; FONT-FAMILY: Arial; mso-ansi-language: EN-US"><span style="mso-spacerun: yes">&nbsp;</span>I am working with a molecule that will count two clusters, co-ordinated for cysteins. 
</span></p>
<p class="MsoNormal" style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><span lang="EN-US" style="COLOR: black; FONT-FAMILY: Arial; mso-ansi-language: EN-US">But in the pdb file does not exist linkings between iron atoms and of the cystens, even so literature affirms that it exists. 
</span></p>
<p class="MsoNormal" style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><span lang="EN-US" style="COLOR: black; FONT-FAMILY: Arial; mso-ansi-language: EN-US">How I can edit this file?</span></p>
<div class="MsoNormal" style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><span lang="EN-US" style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial; mso-ansi-language: EN-US">&nbsp;Therefore when I edited it even so it has if visualized the linkings in this format (pdb), when processing it with pdb2gmx the linkings between&nbsp;irons and atoms SG of the cisteínas these linkings do not appear in the topology archive. What it can be?
</span></div>
<div class="MsoNormal" style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><span lang="EN-US" style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial; mso-ansi-language: EN-US"></span>&nbsp;</div>
<div class="MsoNormal" style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"><span lang="EN-US" style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial; mso-ansi-language: EN-US">E, Silva</span></div>
<p class="MsoNormal" style="MARGIN: 0cm 0cm 0pt"></p>