Hi friends!<br />I have built a fluorescent probe using PRODRG and saved the coordinates without the hydrogens. <br /><br />1. Must I save with hydrogens and charges?<br />2. How to incorporate this onto cysteines. As the coordinates need to be adjusted to the location of Cys when put on the protein before I can perform any MD simulations. Is there any program that may help?? <br />Thanks<br />Jayant James<br />
<br><a href="http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/sigclick.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1507191490@Middle5?PARTNER=3"><IMG SRC="http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/sigimpress.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1963059423@Middle5?OAS_query=null&PARTNER=3" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>