<div><div>Dear All who may concern,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; I have some questions for the
charge calculation in Gromacs, I used the forcefied ffG43a1 for the
protein and inhibitors. Does the charge for the protein is the charge&nbsp;
per residue? This forcefield is just for the polar H, right? For the
nonpolar H, it will merge the H into the Heavy atom, right? I would
like to know that does this force field also calculate the charge for
the nonpolar H and then sum the charge with the heavy atom which it
connects to or it doesn't calculate the charge for the nonpolar H? Does
the charge of the Heavy atom is its own charge without sum together
with the nonpolar H which connect to it? Moreover, I would like to know
that if I would like to use quantum mechanics (qm)&nbsp; to calculate the
charge for my inhibitor, what should be the method and the basis set to
use to calculate for the charge to make it compiles with the ffG43a1
force fields?<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Thank
 you in advance for all of your help. Hope to hear from you soon<br><br>With Best all regard<br></div></div><div><span class="sg"><span>Kanin Wichapong</span>

</span></div>