Hi all<br>&nbsp; I already look in the turorial however that is not the thing that I try to look for. I would like to merge the ligand into the protein and then
make the contrain between two atoms, one from the liagand and one from
the protein. However, as far as I know, I can do the constraint or
restraint just in the one chain. I cant do that with the different
chain. So that i try to merge ligand chain and protein chain. I tried to do that with pdb2gmx but it is not work. So that i would like to
know is there any way to merge the ligand chain with the protein chain.<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Thanks for all your suggstions<br><br>Best Regard<br>Kanin<br>