Hi,<br>&nbsp; set T_couple=no and refer to the following script<br><br>; SIMULATED ANNEALING&nbsp; <br>; Type of annealing for each temperature group (no/single/periodic)<br>annealing&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = single<br>; Number of time points to use for specifying annealing in each group
<br>annealing_npoints&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = 6<br>; List of times at the annealing points for each group<br>annealing_time&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = 0 10 20 30 40 50<br>; Temp. at each annealing point, for each group.<br>annealing_temp&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; = 425 375 325 275 245 203
<br><br><div><span class="gmail_quote">在06-9-13,<b class="gmail_sendername">zzhwise1</b> &lt;<a href="mailto:zzhwise1@163.com">zzhwise1@163.com</a>&gt; 写道:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div><div><font size="4">hello everyone</font></div>
<div><font size="4">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; i want to anneal my system,but i don't konw how to wrote a right annealing-mdp!</font></div>
<div><font size="4">could anyone give me a moldel?</font></div>
<div><font size="4">&nbsp; tanks in advaced!</font></div>
<div>&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div><span></span>
<div>&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div><span></span><br><br><br><br><br><br><div style="border-bottom: 1px solid rgb(153, 153, 153);"></div><br>

        <font style="font-size: 14.8px;" color="black">3G 时 代 来 临 了,坚 决 对 传 统 邮 箱 说 不 !</font>
        <br>
         <a href="http://www.126.com/" style="font-size: 13px; line-height: 160%; color: blue;" target="_blank" onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)">新 一 代 极 速 3G 邮 箱 闪 亮 登 场 ,280 兆 网 盘 免 费 送 ! 点 击 此 处 注 册
</a>


</div><br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">
http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>www interface or send it to <a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">
gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can't post? Read <a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php
</a><br><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Sincerely yours,<br>**********************************************<br>Baofu Qiao, PhD<br>Frankfurt Institute for Advanced Studies<br>Max-von-Laue-Str. 1<br>60438 Frankfurt am Main, Germany TEL:+49-69-7984-7529
<br>**********************************************