Hai all... <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I am a
newbie to gromacs simulation software and its file formats. I want to
develop coarse grain models for surfactant systems by using atomistic
simulations. I got a .pdb file for BTMAC surfactant. <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; But to run
simuations on gromacs,I need to include .itp file in source code. Can
anyone of u tell me,Is it difficult to prepare a .itp file for a new
molecule?? If it is so, I want to know how many days it will take to
prepare....... And also Please tell suggestions to prepare a .itp file
for a new molecule....<br>
<br>
Thanks in advance<br clear="all">-- <br>Arun kumar.V<br>M.E Chemical Engg<br>
<br>