Dear All<br>   I am running a simulation of a DPPC bilayer. I am trying  to compute the INTER molecular RDF s of the P-P atoms, N-P atoms and  N-N atoms in the head of the bilayer. I have 2 questions,<br>    <br>   1)  When I compute RDF using g_rdf, instead of a getting a smoothly  decaying curve at close distances (&lt;0.3 nm) I get a spike (at around  0.22 nm). Is this due to INTRAmolecular RDF contribution? <br>    <br>    2) If so, I probably need to increase the nexcl using a new tpr file  right? What I am wondering is, how much do I need to set the nexcl for  a DPPC molecule and what is the basis for it?<br>    <br>    Thanks a lot<br>    Rama<p>&#32;

<hr size=1>Want to start your own business? Learn how on <a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=41244/*http://smallbusiness.yahoo.com/r-index"> Yahoo! Small Business.</a>