I want to simulate Dendrimers in water using gromacs.<br>i have been having trouble from the first step (using pdb2gmx)<br><br>I have attached the PDB file of the dendrimer.<br><br>Can somebody teach me/ tell me how to go about simulating non-amino acids / polymers like this in GROMACS ? 
<br><br>Is there any online tutorial for this?<br><br>Thanks,<br><span class="sg">Karthikeyan<br></span>