Hello Friends,<br /><br />I am new to gromacs. I configure the gromacs than it did not give me error but when i run make command that it gave me following error.<br /><br />mpicc -O6 -fomit-frame-pointer -finline-functions -Wall -Wno-unused -funroll-all-loops -I/usr/include/libxml2 -o grompp topio.o toppush.o topcat.o topshake.o convparm.o tomorse.o sorting.o splitter.o dum_parm.o readir.o add_par.o topexcl.o toputil.o topdirs.o grompp.o&nbsp; -L/home/sgeadmin/gromacs/gromacs-test/gromacs-3.2/fftw/lib ../mdlib/.libs/libmd_mpi.a -L/usr/X11R6/lib ../gmxlib/.libs/libgmx_mpi.a -lnsl /home/sgeadmin/gromacs/gromacs-test/gromacs-3.2/fftw/lib/librfftw_mpi.a /home/sgeadmin/gromacs/gromacs-test/gromacs-3.2/fftw/lib/libfftw_mpi.a /home/sgeadmin/gromacs/gromacs-test/gromacs-3.2/fftw/lib/librfftw.a /home/sgeadmin/gromacs/gromacs-test/gromacs-3.2/fftw/lib/libfftw.a -lX11 -lxml2 -lz -lpthread -lm<br />/usr/bin/ld: skipping incompatible /usr/X11R6/lib/libX11.so when searching for -lX11<br />/usr/bin/ld: skipping incompatible /usr/X11R6/lib/libX11.a when searching for -lX11<br />/usr/bin/ld: cannot find -lX11<br />collect2: ld returned 1 exit status<br />mpicc: No such file or directory<br />make[3]: *** [grompp] Error 1<br />make[3]: Leaving directory `/home/sgeadmin/gromacs/gromacs-test/gromacs-3.2/gromacs-3.2.1/src/kernel'<br />make[2]: *** [all-recursive] Error 1<br />make[2]: Leaving directory `/home/sgeadmin/gromacs/gromacs-test/gromacs-3.2/gromacs-3.2.1/src'<br />make[1]: *** [all] Error 2<br />make[1]: Leaving directory `/home/sgeadmin/gromacs/gromacs-test/gromacs-3.2/gromacs-3.2.1/src'<br />make: *** [all-recursive] Error 1<br /><br />I think it gave me error for mpicc command but it's there in the path. So please help me in this problem.<br />Thanks in advance<br />
<br><a href="http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/sigclick.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1507191490@Middle5?PARTNER=3"><IMG SRC="http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/sigimpress.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1963059423@Middle5?OAS_query=null&PARTNER=3" BORDER=0 VSPACE=0 HSPACE=0></a>