Dear all:<br>       I have some problems about how to construct PMF(Potential of Mean Force) from the result of AFM pulling function in Gromacs.After the &quot;pull.pdo&quot; file was obtained and the force was calculated using the scripts writen by Prof. , How can I get the PMF from the result(coordinate and force)? <br>       In theory, Should I have to perform several AFM pulling simulation from different start points(conformation and velocity)??<br>       Thanks!I will appreciate it if some one would help me solve this problem? <br><!-- urlfiles --><br><br><!-- footer --><br><br>
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