Dear all,<br>I am running md simulations on a decapeptide, using pressure coupling [npt]. My box is octahedral and box dimensions are set at peptide length plus twice the cut-off as recommended. I have set tau_p to be 1.0 ps. After 1 ns , the average pressure had come down to 
2.6 bar, though fluctuations were quite high. [Standard deviation 150.8 ] But after 6ns, the pressure has risen again to 4.6 bar. Can you please advise me on this? Also, can you please tell me if there is any correlation between pressure average and tau_p values? 
<br>I have attached the md parameters file and the mdout files with this mail. <br>Thanks,<br>Chetana. <br>