Dear All,<br><br>I am running Gromacs 3.3.1 and I have recently installed dssp to run the do_dssp command.<br>I have set the path correctly and the dssp seems to work ok by it self, however when i run do_dssp I get the following message:<br><br><br>There are 25 residues in your selected group<br>Opening library file /home/duartea/gromacs/share/gromacs/top/ss.map<br>trn version: GMX_trn_file (single precision)<br>Reading frame&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0 time&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000<br>Back Off! I just backed up ddlNDmaL to ./#ddlNDmaL.1#<br><br>The processor is working at 100% but no xpm or xvg files are produced... and thereading frame does not change either... <br>Does anybody telm if i am doing something wrong?<br><br>Thanks!<br><br>Afonso<br><br><br><p>&#32;__________________________________________________<br>Fale com seus amigos  de graça com o novo Yahoo! Messenger <br>http://br.messenger.yahoo.com/