<div>Oh...I see. I will try that. I&#39;m re-compiling it just to make sure everything is at default.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Thanks<br><br>&nbsp;</div>
<div><span class="gmail_quote">On 2/9/07, <b class="gmail_sendername">Mark Abraham</b> &lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt; wrote:</span>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">Russell Green wrote:<br>&gt; Pardon my ignorance of Linux...but after remembering I did the standard<br>&gt; install I went searching for /usr/local/ and gromacs is definitely in
<br>&gt; there. I typed the &quot;which mdrun&quot; and I just got some no-result message.<br>&gt; So if the paths are my problem...do I just edit the .bash_profile in the<br>&gt; home/russell/ directy as I have it?<br><br>
If gromacs is in /usr/local/gromacs, then you want to use &#39;source<br>/usr/local/gromacs/bin/GMXRC&#39; in your .bash_profile. If that doesn&#39;t<br>work, cd to /usr/local and do &#39;find * -name &quot;GMXRC&quot;&#39; to find where it is.
<br><br>Mark<br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">
http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org
</a>.<br>Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote></div><br>