<div>OOh...my apologies Mark. I completely missed the &#39;source... part for the path. Please forgive my annoyances...it&#39;s late and I was getting really frustrated. Well I&#39;ve shut down the computer for now because I need some sleep, but I&#39;ll try what you said exactly tomorrow. 
</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Thank you Mark and everyone else for the help.<br><br>&nbsp;</div>
<div><span class="gmail_quote">On 2/9/07, <b class="gmail_sendername">Mark Abraham</b> &lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt; wrote:</span>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">Balamurugan.R wrote:<br>&gt; Hi<br>&gt;<br>&gt; If I am right, the following command in the source directory should do
<br>&gt; the job for you<br>&gt;<br>&gt; ./configure &lt;options&gt;<br>&gt;<br>&gt; make<br>&gt;<br>&gt; make install<br>&gt;<br>&gt; make link<br><br>That&#39;d be &quot;make links&quot;, and that part is optional.<br><br>
&gt; if you have set the path manually, then instead of trying GMXRC, try one<br>&gt; of the below commands<br>&gt;<br>&gt; luck or luck_d<br>&gt;<br>&gt; mdrun –h or mdrun_d -h<br><br>The user&#39;s problem is with setting the PATH, not what to do afterwards.
<br>Please try to read the problem carefully and give useful advice :-)<br><br>Mark<br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org
</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>www interface or send it to 
<a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote>
</div><br>