<div>Hi Mark,</div>
<div>thanks for the prompt reply. i still have some questions.</div>
<ol>
<li>Since i have to install the new version, should i make a clean install.</li>
<li>the version which i am currently using is <u>without</u> MPI, so this time i should be compliing or configuring it with MPI, as i understand.</li>
<li>if i want to run it on a cluster, does all the nodes need to have the same distribution of Linux(i am using Suse 10.1) and also does all nodes need to have GROMACS installed in all of them. </li></ol>
<p>i have gone through the mailing list , it looks like everyone is running it on cluster. could you please suggest any resource or tutorial for understanding the concepts and fundamental of running and performing molecular dynamics calculations in a cluster computing environment. thanks very much for your help. 
</p>
<p>Arindam Ganguly</p>