Dear all<br> <br> I started with 6 residue peptide simulation in water for 1ns. initially i placed the peptide in the center using the command editconf -c flag, but after MD peptide is coming out of the water box. I want to calculate the water molecules around it and peptide interactions with water.<br> <br> Is there an error running simulation.<br> Regards<br> Priya<br> <p>&#32;
        

        
                <hr size=1></hr> 
Here’s a new way to find what you're looking for - <a href="http://us.rd.yahoo.com/mail/in/yanswers/*http://in.answers.yahoo.com/">Yahoo! Answers</a>