<div style="direction: ltr;">Hi all:<br><br>I īm working on membrane peptides simulation under lipid (POPC, from<br>Peter Tieleman group site) and i want to do a popc.itp file using<br>ffG53a5 force field. &nbsp;Some days ago i was working with dppc membranes
<br>and i took &nbsp;one lipid and run it through pdb2gmx,<br>&nbsp;using my favourite force field and include the dppc.itp file in my<br>.top file, but &nbsp; i know that the topology of popc lipid isnīt &nbsp;in the<br>database of gromacs.
<br>I īve obtained the popc.itp (one lipid) of the PRODRG server, but the<br>conformation is bad, i note that when i visualize it in VMD and i<br>analyze some parameters. Also the atom types are different.<br><br>I think i can to converter the 
dppc.itp file in popc.itp file, but i<br>donīt know what to do.<br>Should i take the topology of dppc lipid and modified it including<br>some atoms of the oleoyl chain of the popc lipid (CA1 y CA2 atoms)?<br>Can i find the parameters of the similar bounds of the last atoms and
<br>include it in the dppc.itp file?<br><br>Could anybody help me?<br><br>Thank you for your time<br></div><span class="sg"><br>Maite</span>